私营医疗机构规管办公室（规管办公室）（前身为"医护机构注册办事处"）于2016年4月成立。
规管办公室的牌照科负责处理根据丶《私营医疗机构条例》（第633章）和《诊疗所条例》（第343章）的发牌及规管工作，以及协助香港警务处调查怀疑非法行医的个案。
质素与标准科负责处理根据《私营医疗机构条例》（第633章）对小型执业诊所的豁免申请，发展有关私营医疗机构的标准及规格，为咨询委员会及私营医疗机构投诉委员会提供秘书及研究支援，支援医务卫生局发展私营医院，以及协助教育局根据《教育条例》（第279章）执行有关学校卫生之工作。